京都御所は、東京遷都が行われるまで皇居として使われていた。1790（寛政2）年老中松平定信らが中心となって再建されるまで京都御所の場所は現在の位置より西の千本通あたりにあった。 1864（元治元）年7月19日、禁門の変（蛤御門の変）では、薩摩・会津藩を中心としたの幕府軍と 長州藩との間で激戦で行われた。その激戦地蛤御門には、今でも門の梁などに弾痕が残っている。